系所簡介
生物資訊與醫學工程是一門跨領域的科學，此跨領域學科的出現，其原因可歸納為以下三點：
（一）科學知識以及實驗數據紀錄的數位化
（二）高通量生命科學實驗技術的成熟，能夠在短時間內產生大量的生命科學相關資訊
（三）長時間累積而成的大量生命科學實驗數據及醫療記錄數據
首任校長蔡進發教授於本校在90學年度創校時，即申請成立生物資訊研究所，於91學年度研究所開始招生，專門培養生物資訊人才，為全國首創的生物資訊研究所。設立宗旨在於為了有效率地研究與管理如此大量的資訊，並培養具備資訊科技及生命科學知識的優秀生物資訊人才。
92學年度成立大學部，開始招收四年制大學生，同時亦開始招收碩士在職專班學生，培養業界生物資訊領域人才。其後學系經歷與生物科技學系的合併時期，但是為了順應科技之發展與需求，因應本校十年校務發展計畫中規畫「生物資訊」為學校重點發展方向，遂於96學年度再次獨立為生物資訊學系，同年經教育部獲准設立博士班，成為全國生物資訊領域，唯一具備由學士至博士班完整學制之系所。但是近年來有鑑於醫學資訊領域的發展日趨成熟，利用資訊技術以解決醫學數據研究、醫療資訊分析、醫院系統管理在現代醫學研究與醫療系統管理與分析上的問題，成不可或缺的一環。
本系參酌社會跨領域專業需求及學術發展趨勢，認為培養醫學資訊相關領域人才有其必要性。因此於98學年度向教育部申請更改系名為「生物與醫學資訊學系」，並將大學部分為「生物資訊組」與「醫學資訊組」招生，並於99學年度正式獲准施行。同時設有國際英語學程招收外籍學生，此學程於101、103學年度分別通過教育部全英語學程評鑑，獲得推薦。
在103年4月15日的IEET諮詢委員會暨系所發展委員會中，委員建議因近年來個人化行動裝置與生醫資訊軟體、雲端應用等結合的產品需求性增加，為增加本系學生的就業機會，本系調整發展方向，朝醫學工程領域發展。隨後，在103年 4月22日的系務會議中，本系全體教師討論並決議擬更改系名為「生物資訊與醫學工程學系」，並提請校方審議。經教育部核準後，自104學年度起更改系名為「生物資訊與醫學工程學系」。(如圖一)
【圖一、 組織架構與參與成員】
生醫電子為主要發展核心，結合本校資電學院的資源，培養分析醫學影像與生醫訊號、維護與開發醫療電子設備的人才。除了教學與服務之外，同時鼓勵研究創新的風氣與積極參與國內外活動，以支援一個具良好學術研究風氣的學習環境。
二十一世紀對人才的要求強調不僅須具一技之長，還能進行跨領域的合作。本系期望培育能應用資訊科技方法參與生命科學與醫學之研發以及醫療系統管理的跨領域人才，在職場上發揮加乘的作用。本系除了教學與服務之外，同時鼓勵研究創新的風氣與積極參與國內外活動，以支援一個具良好學術研究風氣的學習環境。
